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摘要近期,一個完全自動化的實驗室誕生,即初創(chuàng)生物技術(shù)公司 Zymergen 的實驗室,人工智能設(shè)置試驗程序,機器人進(jìn)行實驗操作。

  【儀表網(wǎng) 儀表新概念】舊金山灣地區(qū)的初創(chuàng)生物技術(shù)公司 Zymergen 的實驗室,乍看之下普普通通——實驗室的桌子上整齊的放著試管,架子上是各種化學(xué)藥品。然而環(huán)顧四周,你會發(fā)現(xiàn),這個實驗室的工作人員似乎不太一樣,他們身上發(fā)出一些機械運動以及風(fēng)扇的聲音。沒錯,在這個實驗室里工作的全是機器人,這里是 Zymergen 公司的未來生物學(xué)實驗室。
 

 
  在這里你可以看到機器人伸出一個機械手,抓取一個上面有數(shù)百個小孔的塑料板,然后掃描了這個板上的條形碼。下一步動作則是肉眼無法觀察到的,機器人通過給予這個塑料板一個聲波的沖擊,使每個小孔都能濺出一滴小液珠,這個液滴迅速地被機械手獲取,然后送往下一個儀器進(jìn)行分析。相比起傳統(tǒng)上科研人員使用移液器一個孔一個孔的操作,這個機器人 1 秒鐘可以取 500 個樣本。
 
  不過,Zymergen 的科學(xué)家會告訴你,這些一點都不未來。使用機器人進(jìn)行實驗操作,通過條形碼來進(jìn)行記錄都已經(jīng)獲得了相當(dāng)廣泛的應(yīng)用。而通過聲波取液的技術(shù),稱之為聲微滴噴射,甚至已經(jīng)存在了數(shù)十年之久。那么這個實驗室究竟“未來”在哪里呢?Zymergen 的共同創(chuàng)始人 Jed Dean 博士說:“我不知道這些機器人在做什么實驗。因為這些實驗完全是由一個人工智能程序設(shè)計的。”
 
  盡管機器人在實驗室中有了普遍的應(yīng)用,但是,從提出假說、設(shè)計實驗、到分析數(shù)據(jù),這些還都是人類科學(xué)家的工作。對于 Zymergen 來說,他們的目標(biāo)就是完全取代人類科學(xué)家們的作用,由人工智能程序完成這些工作。近一段時間以來在機器學(xué)習(xí)方面的發(fā)展,使得機器人有望完全勝任這些工作。
 
  Zymergen 公司的實際業(yè)務(wù)是想提高可以生產(chǎn)重要工業(yè)原料的微生物的產(chǎn)量,這些原料可以用于生物燃油、塑料、制藥等許多領(lǐng)域。通過改造這些微生物的基因組,Zymergen 想要找到大量提高產(chǎn)量的方法。
 

 
  不過,這些工業(yè)微生物已經(jīng)經(jīng)過多年的選擇和優(yōu)化,要想更進(jìn)一步的提高產(chǎn)量,需要對其基因組進(jìn)行非常深入的研究,并且根據(jù)初步數(shù)據(jù)再做下一步研究。這即使對于非常的科學(xué)家來說也是一件費時費力的事情。Zymergen 執(zhí)行官 Joshua Hoffman 的估計是一個科學(xué)家一個月大約可以完成 10 項實驗。通過傳統(tǒng)機器人的幫助,這個數(shù)字可以提高到每周 1000 項,不過前提是需要給機器人提供正確的實驗設(shè)計和指令,這往往是一個瓶頸。
 
  對于一個有 5000 個不同基因的微生物來說,如果每個基因可以有 10 個變種,那么至少有 50000 個不同的微生物需要測試。你可以從中找出可以提高產(chǎn)量的幾十個,接下來還要對這些不同的單個基因變種的組合進(jìn)行測試。即使每周能夠測試 1000 種,這仍然是一個漫長的過程。此外,光測試產(chǎn)量是不夠的,微生物本身的生長能力也需要密切關(guān)注。而這就是機器學(xué)習(xí)能夠發(fā)揮作用的地方,通過上一步實驗的結(jié)果,機器學(xué)習(xí)算法能夠設(shè)計出下一步需要進(jìn)行試驗的假說。
 
  Hoffman 先生表示,目前為止,Zymergen 能夠提升一些微生物產(chǎn)量的 10%。這看上去是一個小數(shù)字,但是對于年產(chǎn)值 1600 億美元的化學(xué)工業(yè)來說,10% 的提升可能意味著數(shù)十億美元的經(jīng)濟(jì)效益。
 
  不過,人工智能能夠找到提升產(chǎn)量的方法,但是卻不知道其背后的生物學(xué)機制。Dean 博士卻認(rèn)為,這其實是人工智能的優(yōu)勢之一。因為傳統(tǒng)科學(xué)方法只會從已知的與生產(chǎn)特定產(chǎn)品相關(guān)的基因入手,這其實有很大的局限性。Zymergen 的實驗發(fā)現(xiàn),許多人工智能發(fā)現(xiàn)的能夠提高產(chǎn)量的基因變化與其化學(xué)合成通路沒有直接的聯(lián)系,其中甚至許多基因的功能是未知的。
 
  而對于生物學(xué)家來說,這些發(fā)現(xiàn)又是令人激動的。因為他們可以通過提高產(chǎn)量這一結(jié)果出發(fā),進(jìn)行反向推理,這有望揭開更多不為人所知的基因的功能。還有一種更的可能,那就是有一天人工智能程序能夠自己去尋找這背后的機制。到那時,恐怕人類科學(xué)家真的沒有用武之地了。
 
  (原標(biāo)題:生物學(xué)家要失業(yè)了?人工智能在硅谷造了個全自動實驗室)

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