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渦旋振蕩器使用于酵母微粒體的條件優(yōu)化

來(lái)源:上海蟻霖科學(xué)儀器有限公司   2021年11月08日 19:07  

基因重組酵母是一種利用基因重組技術(shù),將外源 目的基因轉(zhuǎn)錄至酵母細(xì)胞中,使之表達(dá)相應(yīng)蛋白的酵 母。重組人代謝酶酵母能夠表達(dá)人肝微粒中不同亞 型的 CYP450 酶,與其他表達(dá)系統(tǒng)(如大腸埃希菌、 哺乳動(dòng)物細(xì)胞和昆蟲細(xì)胞等)相比,具有重組酶表 達(dá)量和催化活性相對(duì)較高、生產(chǎn)周期短以及適合于大 批量制備藥物代謝物等優(yōu)點(diǎn),因而具有突出優(yōu)勢(shì)。 Dragan 等通過重組人 CYP2C9 酵母全細(xì)胞反應(yīng)體 系,制備了雙氯芬酸的代謝物,但是不同藥物的化學(xué) 結(jié)構(gòu)及理化性質(zhì)各不相同, 因此利用重組人 CYP450 酵母全細(xì)胞反應(yīng)體系進(jìn)行不同藥物代謝途徑及代謝 物的篩選仍存在一定困難。



1 材料與方法

1.1 儀器與試劑

1.1.1 儀器


LC-2010AHT 高效液相色譜儀(日本島津公司); 渦旋振蕩器 XW-80A(海門市其林貝爾儀器制造有限 公司);玻璃珠(美國(guó) Biospec 公司,直徑為 0.5 mm); 48 孔板(無(wú)錫耐思生物科技有限公司)。



1.1.2 試劑

重組人 CYP2C9 酵母、 未轉(zhuǎn)染酵母和 4-羥基雙 氯芬酸(純度≥98.0%)由南京珼瑞斯生物醫(yī)藥科技有 限 公 司 提 供 。 還 原 型 酰 胺 腺 嘌 呤 二 核 苷 酸 磷 酸 (NADPH)再生系統(tǒng)試劑購(gòu)自匯智泰康生物技術(shù)(北 京)有限公司。 Lowry 蛋白濃度測(cè)定試劑盒、Yeast Nitrogen Base W/O Amino acids 和 PMSF 購(gòu)自北京索萊 寶科技有限公司。 雙氯芬酸標(biāo)準(zhǔn)品(純度≥98%)和LHistidine 購(gòu)自東京化成工業(yè)株式會(huì)社(TCI)。 Leu Minus media 購(gòu)自北京泛基諾科技有限公司。 Yeast Extract 和 Tryptone 購(gòu)自英國(guó) Oxoid 公司。 葡萄糖和 DL二硫蘇糖醇(DTT)購(gòu)自上海阿拉丁生化科技股份有限 公司。 三(分析純)和二水合 EDTA 二鈉購(gòu)自南 京化學(xué)試劑股份有限公司。 蔗糖購(gòu)自西隴科學(xué)股份 有限公司。 瓊脂粉購(gòu)自國(guó)藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司。



1.2 方法

1.2.1 玻璃珠預(yù)處理


玻璃珠用濃鹽酸浸泡 24 h,濾去濃鹽酸,用去離 子水洗滌至中性,在 60℃烘箱中干燥 16 h,于 4℃保 存。 使用前,將預(yù)處理后的玻璃珠置于冰上備用。



1.2.2 未轉(zhuǎn)染酵母菌和重組人CYP2C9 酵母菌的培養(yǎng)

1.2.2.1 SD-His 培養(yǎng)基(g/L)


Yeast Nitrogen Base W/O Amino acids 6.7,L-Histidine 0.02,葡萄糖 20,瓊脂粉 20(制備固體培養(yǎng)基時(shí)添加)。 使用前,于 115℃滅菌 30 min,葡萄糖配制成 20%溶液?jiǎn)为?dú)滅菌。



1.2.2.2 YPD 培養(yǎng)基(g/L)

Yeast Extract 10,Tryptone 20, 葡萄糖 20,瓊脂粉 20(制備固體培養(yǎng)基時(shí)添加)。 使用 前,于 115℃滅菌 30 min,葡萄糖配制成 20%溶液?jiǎn)?獨(dú)滅菌。



1.2.2.3 未轉(zhuǎn)染酵母菌培養(yǎng)流程

將甘油中保存的未 轉(zhuǎn)染酵母菌接種至 YPD 固體培養(yǎng)基上, 放置生化培 養(yǎng)箱中培養(yǎng) 3 d(30℃)。 3 d 后取 16 個(gè)單顆菌落(直 徑≥2 mm), 轉(zhuǎn)移至含有 1400 ml YPD 培養(yǎng)基的 2 L 三角培養(yǎng)瓶中,培養(yǎng) 3 d(30℃,200 r/min)。 離心稱重, 按照菌重與培養(yǎng)基體積比 1∶1 加入 YPD 培養(yǎng)基,于 4℃保存?zhèn)溆谩?/span>



1.2.2.4 重組人 CYP2C9 酵母培養(yǎng)流程

將甘油中保存 的重組人 CYP2C9 酵母菌接種至 SD-His 固體培養(yǎng)基 上,放置培養(yǎng)箱中培養(yǎng) 5 d(30℃)。5 d 后取 16 個(gè)單顆 菌落(直徑≥2 mm),轉(zhuǎn)移到含有 200 ml SD-His 液體 培養(yǎng)基的 500 ml 三角培養(yǎng)瓶中,培養(yǎng) 40~48 h(30℃、 200 r/min)。 40~48 h 后將培養(yǎng)基全部轉(zhuǎn)移至 2 L 的三 角培養(yǎng)瓶中, 并加入 1400 ml YPD 培養(yǎng)基, 培養(yǎng) 2 d (30℃、200 r/min)。 離心稱重,按照菌重與培養(yǎng)基體積 比 1∶1 加入 SD-His 培養(yǎng)基,于 4℃保存?zhèn)溆谩?/span>



1.2.3 未轉(zhuǎn)染酵母微粒體和重組人 CYP2C9 酵母微粒 體的制備

1.2.3.1 酵母微粒體緩沖液的制備


10%蔗糖,0.1 mol/L pH 7.4 磷 酸 鉀 緩 沖 液 ,0.1 mmol/L DTT,0.1 mmol/L EDTA(臨用前加入 1 mmol/L PMSF)。



1.2.3.2 未轉(zhuǎn)染酵母微粒體的制備

取所培養(yǎng)未轉(zhuǎn)染 酵母菌菌液 5 ml(約含酵母菌 2.5 g),離心除去 YPD培養(yǎng)基,按菌重與緩沖液體積比 1∶1 加入酵母微粒體 緩沖液,渦旋使之充分混懸。將混懸液分裝入 2 ml EP 管中,使得每個(gè) EP 管中含有 1 ml 混懸液(約含酵母 菌 0.5 g),并分別加入 0.5 g 玻璃珠,在渦旋振蕩器上 渦旋振蕩 30 次(每次渦旋振蕩 30 s,冰上冷卻 60 s), 離心(1000 g,10 min)取上清,再次離心(5000 g,1 h) 取 上 清 , 上 清 即 為 未 轉(zhuǎn) 染 酵 母 微 粒 體 混 懸 液。 于-20℃保存。



2 結(jié)果

2.1 利用 HPLC 測(cè)定酵母微粒體反應(yīng)體系中雙氯芬酸 及其代謝物的含量


CYP2C9 酵母微粒體(制備條件為渦 旋振蕩 30 次,0.5 g 玻璃珠)反應(yīng) 0 h 和 1 h 樣品及未 轉(zhuǎn)染酵母微粒體反應(yīng) 0 h 和 1 h 樣品的 HPLC 檢測(cè)結(jié) 果色譜圖。 雙氯芬酸、代謝物 4-羥基雙氯芬酸及內(nèi)標(biāo) *在“1.2.6”項(xiàng)的 HPLC 色譜條件下分離度良 好,保留時(shí)間分別為 11.08 min、5.13 min 和 3.74 min。 僅在重組人 CYP2C9 酵母微粒體反應(yīng) 1 h 的樣 品 HPLC 圖譜中發(fā)現(xiàn)雙氯芬酸代謝物 4-羥基雙氯芬 酸的色譜峰,而其他樣品的 HPLC 圖譜中未 出現(xiàn)此峰(圖 1A、1C 和 1D)。



2.2 渦旋振蕩次數(shù)對(duì)重組人

CYP2C9 酵母微粒體蛋白 活性的影響 探討渦旋振蕩次數(shù)對(duì)所制備微粒體蛋白活性的 影響時(shí),玻璃珠的用量為 0.5 g。 隨著渦旋振蕩次數(shù)的 增加,所制備酵母微粒體蛋白含量呈增加趨勢(shì),在渦 旋振蕩次數(shù)為 50 次時(shí), 蛋白含量趨于穩(wěn)定, 約為 22.49 mg/ml(圖 2A)。 代謝物 4-羥基雙氯芬酸的生成 量在渦旋振蕩次數(shù)為 30 次時(shí), 為 1.82 μg ,且單位時(shí)間單位蛋白所生成的代謝物量也, 為 0.10 μg/[(mg/ml)·h](圖 2C),隨后都呈下降趨勢(shì)。



3 討論

酵母細(xì)胞壁厚實(shí),影響胞內(nèi)外物質(zhì)的接觸,因 此細(xì)胞破壁對(duì)提高酵母利用率非常重要。 目前常用的 酵母破壁方法有酶解法、超聲波破碎法、勻漿破碎 法和玻璃珠破碎法等,其中玻璃珠破碎法具有操 作簡(jiǎn)單,可以同時(shí)處理多個(gè)樣品,且對(duì)酶活力和環(huán)境 的損害較小等優(yōu)點(diǎn)。 Donnell 等比較了玻璃勻漿 器、珠磨機(jī)、超聲破碎和玻璃珠渦旋振蕩等 7 種破碎 莢膜葡萄球菌酵母細(xì)胞壁提取鋅金屬蛋白的方法,結(jié)果表明玻璃珠渦旋振蕩的方法對(duì)提取鋅金屬蛋白利,蛋白變性量最小。 制備重組人代謝酶酵母微粒 體通常也是采用玻璃珠渦旋振蕩的方法。 為了保 留較強(qiáng)的蛋白活性,避免微粒體蛋白因長(zhǎng)時(shí)間渦旋振 蕩產(chǎn)熱而失活,本研究采用渦旋振蕩 30 s,冰上冷卻 60 s 的方式,重復(fù)多次渦旋振蕩。 研究結(jié)果顯示,所有 不同條件制備的重組人 CYP2C9 酵母微粒體蛋白均 具有一定的活性。





 

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