熒光原位雜交技術技術原理  是將熒光素直接或間接標記的核酸探針[或生物素、dinit rophenyl（I）NP）aminoacetylAAFfluorine（AAF）等標記的核酸探針與待測樣本中的核酸序列按照堿基互補配對的原則進行雜交，經洗滌后直接在熒光顯微鏡下觀察。

熒光原位雜交技術是一種重要的非放射性原位雜交技術，原理是利用報告分子（生物素）標記核酸探針，然后將探針與染色體或DNA纖維切片上的靶DNA雜交，若兩者同源互補，即可形成靶DNA與核酸探針的雜交體。此時可利用該報告分子與熒光素標記的特異親和素之間的免疫化學反應，經熒光檢測體系在鏡下對待DNA進行定性、定量或相對定位分析。

與其他原位雜交技術相比，熒光原位雜交具有很多優點，主要體現在：

①FISH不需要放射性同位素標記，更經濟安全。

②FISH的實驗周期短，探針穩定性高，特異性好，定位準確，能迅速得到結果。

③FISH通過多次免疫化學反應，使雜交信號增強，靈敏度提高，其靈敏度與放射性探針相當。

④多色FISH通過在同一個核中顯示不同的顏色可同時檢測多種序列。

⑤既可以在玻片上顯示中期染色體數量或結構的變化。也可以在懸液中顯示間期染色體DNA的結構。