風力發電控制器是對風力發電機所發的電能進行調節和控制，一方面把調整后的能量送往直流負載或交流負載，另一方面把多余的能量按蓄電池的特性曲線對蓄電池組進行充電，當所發的電不能滿足負載需要時，控制器又把蓄電池的電能送往負載。蓄電池充滿電后，控制器要控制蓄電池不被過充。當蓄電池所儲存的電能放完時，控制器要控制蓄電池不被過放電，保護蓄電池。

控制器采用PWM無級卸載方式控制風機對蓄電池進行智能充電。在風力發電機所發出的電能超過蓄電池存儲量時，控制系統必須將多余的能量消耗掉。普通的控制方式是將整個卸荷全部接上，此時蓄電池一般還沒有充滿，但能量卻全部被消耗在卸荷上，從而造成了能量的浪費。有的則采用分階段接上卸荷，階段越多，控制效果越好，但一般只能做到五六級左右，所以效果仍不夠理想，好控制方式是采用PWM（脈寬調制）方式進行無級卸載，即可以達到上千級的卸載。所以，在正常卸載情況下，可確保蓄電池電壓始終穩定在浮充電壓點，而只是將多余的電能釋放到卸荷上。從而保證了最佳的蓄電池充電特性，使得電能得到充分利用。

由于蓄電池只能承受一定的充電電流和浮充電壓，過電流和過電壓充電都會對蓄電池造成嚴重的損害。WIN-POWER控制器通過單片機實時檢測蓄電池的充電電壓和充電電流，并通過控制風機充電電流來限制蓄電池的充電電壓和充電電流，確保蓄電池既可以充滿，又不會損壞。從而確保了蓄電池的使用壽命。