GCMS-QP2010 Plus在工廠通過了瞬間斷電的測試。在一個電源周期當中，不會發生故障，比如對于50Hz來說一個周期就是20msec。諸如信號傳輸錯誤，真空錯誤的 發生大約出現在100msec以后，同時正在進行的分析將被停止。對于那種持續性的意外斷電GCMS設備將處于停止狀態；對于間歇性的意外斷電，GCMS 將會在電源恢復時重新啟動(此時各部分的溫度不會上升)；對于頻繁的意外斷電，GCMS將不會啟動真空。
　　長達十數小時甚至幾十小時的意外斷電 可能會造成MS部分的污染。這些污染主要來自于機械泵油的擴散，由于負壓的作用,機械泵油的蒸汽可能會被倒吸入真空腔體內。為了減少這種危險的發生，島津 公司的GCMS系統具有 ” Vacuum Restart Mode(真空自動重啟) ” 功能。在意外斷電之前將 ” Vacuum Restart Mode(真空自動重啟) ” 功能打開(此時的真空系統應處于 ” Ready ” 狀態)。在遭遇意外斷電又再次來電的時候, “ 自動啟動電路 “ 將動作，真空系統可以得到恢復，但此時為安全考慮，離子源和GC部分的溫度不會上升。如果不啟動這個功能，MS的真空系統部分不會啟動。
另外，在電源恢復時GC部分將按照 ” Start Mode(啟動模式) ” 進行重啟。” Semi-Auto(半自動) ”是GCMS系統中的常用設定：載氣自動打開，柱前壓恢復到意外斷電之前的設定值。其它的GC單元(比如進樣口、柱溫箱)由于沒有自動打開而不會升溫。
　　不管怎樣，意外斷電會導致分析停止，損失寶貴的樣品，為避免損失，我們推薦使用不間斷電源(UPS)。